1、原则上是先治愈卵巢囊肿，再做人流手术，以防止对身体带来损害，从而影响手术。但是，如果囊肿是不是太大的话，或者属于生理性的囊肿，这样可以先做人流手术，然后在定期观察囊肿的发展。
2、如果可以先做人流的话还是需要根据囊肿的大小，选择适合的方式治疗。卵巢囊肿的治疗方式取决于患者年龄症状是否恶变囊肿的部位体积大小生长速度造成子宫附件的变形情况是否保留生育功能及患者的主观愿望等因素而定。
3、同时，由于人流手术有时间规定，太早太晚都不适宜，因此要注意时间的安排。而且选择无痛人流的话还有禁忌症的，孕妇如果有这些症状是不适合做人流的。
无痛人流的禁忌症包括：
①各种急性传染病或慢性传染病急性发作期、严重的全身性疾病如心力衰竭、症状明显的高血压、伴有高热的肺结核以及严重贫血等不能承受手术者，需待治疗好转后住院手术;
②生殖器官急性炎症，如阴道炎、重度宫颈糜烂、盆腔炎等;
③妊娠剧烈呕吐引起的酸中毒尚未纠正者;
④术前4小时内，两次体温在37.5℃以上者;
⑤术前3天有同房者。必须是妊娠24周之前进行。
人流不是说想做就能够做的，本身孕妇在早期做还可以，但是在中期之后就比较麻烦，加上有卵巢囊肿的话，更是要综合来看时候可以人流。
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