支原体咳嗽的四个阶段用药可根据疾病进展选择对症治疗，包括抗生素、止咳药物及辅助对症治疗药物等。
支原体感染初期（潜伏期），症状不明显，此时一般无需用药，但做好免疫支持非常重要，比如补充维生素C、注意休息。进入早期症状阶段出现轻微咳嗽和咽喉不适时，可适当使用缓解症状的药物，如含有右美沙芬的非处方止咳药物。发展到急性咳嗽阶段时，通常需要针对感染源的抗生素治疗，如阿奇霉素、多西环素或克拉霉素，其中阿奇霉素是儿童和成人的首选。若咳嗽持续，症状转为慢性阶段，可辅助使用治疗气道炎症的消炎药物或雾化吸入药物帮助改善呼吸功能，配合长期作息管理。严重的持续咳嗽需要在医生指导下调整抗生素用药方案或进一步检查。
患者在治疗过程中应注意避免自行停药或更换药物，尤其是抗生素，确保疗程足够以防感染复发。同时应保持空气湿润，避免接触刺激性气体。饮食上可以多食用富含维生素的水果、清淡易消化的食物，加强免疫力。若症状未减轻或出现呼吸急促等严重表现，需及时前往医院进一步检查和治疗。
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