新生儿脑炎的早期症状主要有发热、喂养困难、嗜睡或烦躁、肌张力异常、前囟膨隆。
体温异常升高是常见首发表现，多超过38℃且对抗热药物反应差。由于新生儿体温调节中枢未完善，持续发热可能提示中枢神经系统感染，需密切监测体温曲线变化。
表现为吸吮无力、拒奶或频繁吐奶。脑炎会影响脑干反射弧，导致吞咽协调功能下降，24小时内摄入量减少50%以上需警惕。
意识状态改变具有特征性，或表现为异常安静睡眠超20小时/日，或出现难以安抚的哭闹。这种觉醒度改变反映大脑皮层功能受损。
可能出现全身松软蛙样体位或肢体强直。检查时可发现原始反射减弱或亢进，提示锥体束或基底节受累。
门未闭合时可见前囟张力增高甚至搏动感，伴随头围增速过快。这是颅内压增高的特异性表现，需紧急处理以防脑疝。
日常需保持环境安静避光，喂养时采用少量多次方式，注意记录每日进食量、清醒时长及异常动作。发现任何症状持续2小时以上应立即就医，转运过程中保持侧卧位防止误吸。母乳喂养者母亲需加强营养摄入，人工喂养可选择含有核苷酸的配方奶。每日进行被动肢体活动预防关节挛缩，抚触按摩每次10分钟、每日3次有助于改善肌张力。
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