手足口病主要通过接触传播、飞沫传播、粪口传播、污染物传播及母婴垂直传播五种途径传播。
直接接触患者疱疹液、唾液、粪便等分泌物是主要传播方式。儿童玩耍时皮肤接触被污染的玩具、毛巾等物品后，通过揉眼、摸口等行为易导致感染。患者发病后第一周传染性最强，需隔离至疱疹结痂。
患者咳嗽、打喷嚏时产生的含病毒飞沫可经呼吸道传播。在幼儿园等密闭场所，2米内未佩戴口罩的密切接触者感染风险显著增加。柯萨奇病毒A16型和肠道病毒71型为主要病原体。
病毒通过粪便排出后可污染水源或食物。婴幼儿尿布更换区域若消毒不彻底，护理人员手部沾染病毒后经饮食传播。病毒在体外存活时间长，4℃水中可存活数周。
被病毒污染的玩具、餐具、门把手等物体表面可成为传播媒介。肠道病毒对乙醚、紫外线敏感，但普通酒精消毒效果有限，需使用含氯消毒剂处理污染物。
孕妇分娩时若感染肠道病毒，可能通过产道传染新生儿。妊娠晚期感染可能导致胎儿宫内窘迫，需加强产前检查。母乳喂养时母亲应严格洗手，避免乳头皲裂导致体液接触。
预防手足口病需注意个人卫生，饭前便后使用流动水洗手至少20秒；儿童餐具每日煮沸消毒，玩具定期用含氯消毒剂擦拭；流行季节避免前往人群密集场所，居家保持通风。患者衣物应单独清洗并在阳光下暴晒，康复后仍建议继续观察1周。托幼机构发现病例需立即隔离，对活动场所进行终末消毒，密切接触者建议医学观察10天。
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