支原体感染引起的咳嗽通常持续2-4周，具体恢复时间与患者年龄、免疫状态、是否规范治疗、有无并发症以及病原体耐药性等因素相关。
儿童及老年人病程可能延长。儿童免疫系统发育不完善，呼吸道清除能力较弱；老年人常合并慢性病，组织修复速度较慢。这两类人群咳嗽症状可能持续3周以上，需加强营养支持与休息。
免疫功能低下者恢复较慢。长期使用免疫抑制剂、糖尿病患者或HIV感染者，因机体对抗病原体能力下降，咳嗽持续时间可达4-6周，需在医生指导下调整治疗方案。
未足疗程用药易导致迁延不愈。支原体对大环内酯类抗生素敏感，但随意停药可能诱发耐药性，使咳嗽症状反复。规范使用阿奇霉素、克拉霉素等药物需完成7-10天疗程。
合并支气管炎或肺炎时病程延长。支原体感染向下呼吸道蔓延会引起持续低热、脓痰，咳嗽可能持续1个月以上，需行胸片检查评估肺部情况。
耐药支原体株延长康复时间。部分地区出现对大环内酯类耐药的支原体变异株，此时需换用多西环素或莫西沙星等二线药物，咳嗽缓解时间可能推迟1-2周。
支原体感染期间建议保持每日2000毫升温水摄入，食用百合银耳羹等润肺食物，避免辛辣刺激。咳嗽剧烈时可练习腹式呼吸缓解症状，卧室使用加湿器维持50%-60%湿度。恢复期应避免剧烈运动，注意观察痰液颜色变化，若出现血丝或铁锈色痰需立即复诊。病程超过4周未愈者需排除哮喘、结核等继发病变。
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