肺炎支原体感染多数情况下属于轻中度疾病，但婴幼儿、老年人或免疫力低下者可能出现严重并发症。病情严重程度与感染者年龄、基础疾病、是否及时治疗等因素相关。
肺炎支原体感染常见表现为持续性干咳、低热、咽痛等呼吸道症状，病程通常持续数周。多数健康人群感染后可通过自身免疫力逐渐恢复，部分患者需使用大环内酯类抗生素如阿奇霉素、克拉霉素等缩短病程。儿童患者可能出现喘息或肺炎表现，但极少进展至呼吸衰竭。
免疫功能缺陷患者、慢性心肺疾病患者或早产儿感染后可能引发重症肺炎、胸腔积液等并发症。极少数病例会累及中枢神经系统或血液系统，出现脑膜炎、溶血性贫血等危重情况。这类高危人群需住院监测并接受静脉抗生素治疗，必要时需氧疗支持。
肺炎支原体感染期间应保证充足休息，适量增加水分摄入以稀释呼吸道分泌物。饮食宜选择易消化的高蛋白食物如鸡蛋羹、鱼肉粥，避免辛辣刺激食物加重咳嗽症状。儿童患者家长需密切观察呼吸频率与精神状态，若出现持续高热、呼吸急促或意识改变应立即就医。恢复期可进行温和的呼吸训练如腹式呼吸，但应避免剧烈运动直至症状完全缓解。
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