肺脓肿通常需根据病原体选择抗生素，临床常用药物包括青霉素类、头孢菌素类、克林霉素及甲硝唑等。治疗效果受细菌培养结果、耐药性、患者基础疾病等因素影响。
青霉素G是治疗厌氧菌和链球菌感染的一线药物，对口腔菌群引起的肺脓肿效果显著。若患者对青霉素过敏，可选用氨苄西林等广谱青霉素。需注意部分菌株可能产生β-内酰胺酶导致耐药。
头孢曲松或头孢噻肟适用于需氧革兰阴性杆菌混合感染。第三代头孢菌素对肺炎克雷伯菌等常见致病菌覆盖率高，常与抗厌氧菌药物联用。严重感染时可选择头孢哌酮舒巴坦。
针对厌氧菌尤其是脆弱拟杆菌感染的首选，能有效穿透脓肿壁。该药对大多数口腔厌氧菌敏感，但需警惕假膜性肠炎等不良反应。常与氨基糖苷类联用处理需氧菌。
专性抗厌氧菌药物，对产β-内酰胺酶的脆弱拟杆菌效果明确。通常作为联合用药的组成部分，单用可能遗漏需氧菌感染。用药期间需禁酒以避免双硫仑样反应。
美罗培南等药物作为广谱抗生素适用于多重耐药菌感染或重症患者。对ESBL阳性肠杆菌科细菌和铜绿假单胞菌有强效，但需警惕二重感染风险，一般作为保留方案。
肺脓肿患者应保证每日2000毫升以上饮水量以促进排痰，饮食需高蛋白、高维生素支持机体修复。急性期需卧床休息，体温正常后可逐步进行呼吸训练。治疗期间密切监测痰液性状变化，定期复查胸部影像评估脓腔吸收情况。避免吸烟及接触冷空气等呼吸道刺激因素，恢复期建议接种肺炎球菌疫苗预防复发。
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