肥厚型梗阻性心肌病的病因主要与遗传因素、基因突变、心肌细胞排列紊乱、心脏负荷异常及内分泌代谢异常等因素有关。该病属于常染色体显性遗传病，约半数患者有家族史，可能与肌节蛋白基因突变相关。
肥厚型梗阻性心肌病具有明显的家族聚集性，约50%病例由遗传导致。目前已发现超过20种肌节蛋白基因突变与此病相关，如MYH7、MYBPC3等基因突变可干扰心肌收缩蛋白结构，导致心肌细胞异常增生。对于有家族史者，建议通过基因检测筛查突变位点，并定期进行心脏超声监测。
除遗传性突变外，部分患者为散发性基因突变所致。突变基因多编码肌节蛋白，如肌球蛋白重链或肌钙蛋白，这些蛋白功能异常会导致心肌纤维排列紊乱、室间隔不对称增厚。基因检测可辅助诊断，但需结合临床表现和影像学检查综合判断。
病理表现为心肌纤维结构紊乱、间质纤维化，可能与钙离子调节异常或能量代谢障碍有关。显微镜下可见心肌细胞肥大、排列方向杂乱，这种结构异常可加重左心室流出道梗阻，引发呼吸困难、胸痛等症状。β受体阻滞剂如美托洛尔片可缓解症状。
长期高血压或主动脉瓣狭窄等疾病可能加重心脏后负荷，间接促进心肌代偿性肥厚。但此类继发性肥厚通常对称，与肥厚型梗阻性心肌病的非对称性室间隔增厚不同。控制血压可延缓病情进展，常用药物包括盐酸贝那普利片等血管紧张素转化酶抑制剂。
甲状腺功能亢进、肢端肥大症等内分泌疾病可能通过激素刺激心肌细胞生长。此外，线粒体功能异常导致的能量代谢障碍也可能参与发病。针对原发病治疗如甲巯咪唑片控制甲亢，有助于改善心肌病变。
肥厚型梗阻性心肌病患者需避免剧烈运动、情绪激动等增加心脏负荷的行为，饮食上应低盐低脂，限制咖啡因摄入。定期复查心脏超声评估病情变化，若出现晕厥或心力衰竭症状需及时就医。遗传咨询对家族成员筛查具有重要意义。
