男性非淋菌性尿道炎的症状主要有尿道刺痒、尿频尿急、尿道分泌物增多、会阴部坠胀疼痛、全身性继发损害表现等。
尿道刺痒是男性非淋菌性尿道炎早期常见的症状，表现为尿道内有轻微的蚁行感或明显的刺痒不适，时轻时重，在排尿起始段或晨起时往往更为突出。部分患者可同时感到尿道口灼热或轻微红肿，但整体不适感通常较淋病轻微。刺痒症状容易在饮酒、食用辛辣刺激食物或久坐后加重，患者可能因反复搔抓会阴区域而导致局部皮肤损伤，加大继发感染的概率。尿道刺痒虽是局部感受，但反映出尿道黏膜已经出现炎症反应，应尽早重视，避免延误治疗。
尿频尿急在男性非淋菌性尿道炎早期即可出现，炎症刺激膀胱颈部和后尿道，导致排尿次数增多，每次尿量较少，同时伴有难以忍耐的急迫感。部分患者排尿终末时可有轻微灼痛或刺痛，但疼痛程度一般不如急性细菌性膀胱炎剧烈。尿频尿急会干扰正常工作和休息，尤其在夜间更为明显，影响睡眠质量。若炎症持续刺激，排尿不适可反复出现并逐渐加重，导致患者精神紧张，进一步加重排尿异常感。该症状提示尿道黏膜屏障功能受损，需要及时进行规范抗感染治疗。
尿道分泌物增多是男性非淋菌性尿道炎进展期的典型表现。分泌物通常量较少，呈浆液性或黏液脓性，颜色为透明或淡黄色，较淋病患者的脓性分泌物稀薄。晨起时尿道口可见少量分泌物干涸后形成的痂膜，或表现为内裤上有污渍。部分患者仅在挤压尿道时才出现少量分泌物，容易被忽视。尿道分泌物的出现意味着病原体在尿道黏膜大量繁殖，炎症反应加剧，具有传染性。若长时间未处理，分泌物性状可能发生变化，提示感染范围进一步扩大，增加治疗难度。
会阴部坠胀疼痛多见于男性非淋菌性尿道炎进展期和后期阶段，炎症波及其他部位时，可引起会阴区域、阴囊或腹股沟区的隐痛与坠胀不适。久坐、长时间骑行或排大便后，疼痛可能加重，平卧休息后可有所缓解。部分患者伴有睾丸或附睾部位的牵拉感，严重时可放射至大腿内侧。会阴坠胀症状反映出炎症已不仅局限于尿道黏膜，可能累及前列腺、精囊等邻近器官，导致盆腔区域充血水肿。该阶段病情往往迁延，治疗周期可能延长，并需警惕慢性盆腔疼痛综合征的形成。
全身性继发损害表现属于男性非淋菌性尿道炎未得到及时有效控制后的终末期表现。炎症逆行扩散可引发急性附睾炎、前列腺炎或精囊炎，患者出现发热、乏力、腰部酸痛、射精疼痛或血性精液等症状。双侧附睾慢性炎症可能导致输精管道梗阻，影响精子质量与排出，增加不育风险。少数患者可并发反应性关节炎，表现为关节肿胀、疼痛，以及眼部结膜炎等泌尿生殖系统以外的炎性损害。该阶段说明感染已造成多器官受累，需尽早进行全面评估与规范治疗，避免发生不可逆的组织损伤。
男性非淋菌性尿道炎患者日常护理中应多饮水，增加排尿次数以冲刷尿道中的炎性分泌物，避免饮用浓茶、咖啡及酒精类饮品，减少对尿道黏膜的刺激。饮食以清淡为主，适量摄入富含维生素的新鲜蔬菜水果，少吃辛辣、油腻及高糖食物。注意休息，避免熬夜和过度劳累，适当进行散步、慢跑等有氧运动，增强身体抵抗力。保持会阴部清洁干燥，穿宽松透气的棉质内裤并勤换洗，毛巾和浴盆单独使用，避免交叉感染。治疗期间配合进行伴侣检查与治疗，按时复查，未完全康复前建议暂停性生活，防止反复传播。
