一般来说肾盂肾炎的临床表现多种多样，很多肾盂肾炎的临床表现都被视为并发症的现象。儿童如果患上肾盂肾炎，就很容易出现胃疼，这种肾盂肾炎的临床表现就是引发肠胃炎的预兆，需要进行及时的诊断。
由于肾盂肾炎是上尿路感染性疾病，尿频、尿急等膀胱刺激症状一般都不是肾盂肾炎的临床表现，所以患者往往忽视了尿检而得不到明确诊断。
肾功能不全时容易出现恶心、呕吐等消化道症状，但对于儿童来说，无论是急性或慢性肾盂肾炎，均容易并发胃十二指肠炎，即使肾功能正常，上消化道症状也常常表现突出。此外，由于消化器官和泌尿器官都是人体新陈代谢的两个始末器官，彼此的功能活动紧密相连，二者很容易同时受损。
一项研究发现，4～15岁的急性和慢性肾盂肾炎儿童患者中，绝大部分肾盂肾炎患者是女孩，其中71%肾盂肾炎的临床表现出现胃疼，患有胃十二指肠炎。
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