药物治疗是最为普遍的甲亢治疗方法，其优点是：疗效较为肯定;一般不会引发永久性甲减;方便、经济、安全。但是也有一定的缺点：疗程较长，一般需1~2年，有时长达数年;停药后复发率较高，少数病人可发生严重肝损害或粒细胞缺乏症等。
常用抗甲状腺药物分为硫脲类和咪唑类，其作用相同，都可以抑制甲状腺激素的合成。
适应药物治疗的人群：病情较轻，甲状腺呈轻、中度肿大者;年龄在20岁以下或孕妇、年迈体弱或合并严重心、肝、肾疾病等不宜手术者;甲状腺次全切除术后复发而不宜用放射性碘治疗者。
剂量与疗程：治疗过程分为初始期、减量其及维持期，按病情轻重决定剂量。
不良反应：主要有粒细胞减少，严重时可致粒细胞缺乏症，多发生在用药后2~3个月内。此外，药疹多常见，多用抗组胺药控制。
复发与停药：复发是指甲亢完全缓解后，停药半年后又有反复者，主要发生在停药后一年，三年后复发会明显减少。
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