治疗抑郁症的药物种类较多，在选择时应注意一下这些原则。
安全性：无论什么药物，首先考虑的都是安全性。如三环类药物，中毒后会导致致死性的心律失常；非三环类的抗抑郁药在过量时对心血管的毒性虽不构成严重问题，但5-羟色胺和去甲肾上腺素再摄取抑制剂(SNRI)类药物（如文拉法辛）在高剂量使用时会出现与剂量相关的血压升高。
SSRI药物（舍曲林除外)，如与其他药物合用，易相互作用，可能引起严重后果。但就目前的研究结果，在长期应用单一抗抑郁药物方面，SSRI类药的安全性仍较高，一般列为首选。
耐受性：与三环类和传统单胺氧化酶抑制剂相比，SSRI类药物耐受性已有长足的进步，但它会导致性功能障碍。
疗效：对于任何一种抗抑郁药物，都有将近1／3的抑郁症患者无法取得显着的疗效，解决这些问题一般采用联合用药或使用具有多重作用机制的药物。
要想获得较好的抗抑郁疗效，必须根据患者的不同症状进行药物选择，但应以不良反应少、安全性高的药物为首选，这样既可减轻副作用，又能保证疗效。
简便程度：理想的抗抑郁药应符合以下几点：可以从有效剂量起步，不需要调定剂量；容易确定适宜剂量；不需要特殊的实验室检查以检测药物毒性；可以每日服1次药。现有的抗抑郁药中，符合上述标准的包括多数SSRI类药物、米他扎平，文拉法辛等。
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