系统性红斑狼疮是一种多因素（遗传、性激素、环境、感染、药物、免疫反应各环节）参与的特异性的自身免疫性疾病，患者突出表现为多种自身抗体，并通过免疫复合物的途径，造成周身几乎每一系统、每一器官都可能受累。
其中，免疫系统紊乱贯穿了系统性红斑狼疮的整个发病过程，遗传在内的易感因素加上外在的环境因素（也包括感染以及其他不明原因的刺激等等），导致免疫系统发生异常的免疫应答，持续产生大量的致病性自身抗体（其中较为重要的是抗双链DNA抗体、抗核抗体以及抗Sm抗体等等）引起组织损伤。自身抗体可以与人体循环当中的自身抗原形成免疫复合物而致病。免疫复合物的形成和沉积是系统性红斑狼疮的主要发病机制。
对于怀疑为系统性红斑狼疮的患者来说，可通过相关实验室及其他检查来辅助诊断。
此类患者的免疫系统的检查包括免疫球蛋白及补体的检查，患者血清中可检测到多种自身抗体，如双链DNA抗体、抗磷脂抗体等，以上抗体在分类诊断中的敏感性和特异性各不相同。
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