附睾炎是指各种致病因素引起的附睾炎性病变，其病因主要有以下两种：
病原体感染
微生物感染附睾是引起附睾炎最常见的原因。
引起附睾炎的病原体可以见到的有细菌、真菌、支原体、衣原体、放线菌、寄生虫及病毒。各种病原体可以单独感染附睾，也可以多个种类或多个型别混合感染附睾。
其中急性附睾炎以革兰阴性细菌及性接触传播病原体感染较为常见。慢性附睾炎则以革兰阳性细菌感染较为常见。
病原性细菌、病毒及其他病原微生物或寄生虫以及人体正常菌群中肠道杆菌的绝大多数菌种由于具有较强的毒力并能迅速生长繁殖，因此感染附睾后常可引起附睾的急性显性感染。而革兰阳性细菌的许多菌种以及酵母菌的某些菌种感染附睾后，则常形成隐性感染或无症状带菌状态。
阴囊由于受到外力的直接打击、穿刺及因此而造成的附睾扭转常可伤及附睾引起附睾的创伤性炎症反应。因外伤所致的尿液逆流进入附睾亦可引起附睾的化学性炎症。此外，由于创伤等因素造成阴囊血肿后导致的继发性附睾炎症也可见到。
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