精神分裂症的病因尚末完全阐明，较公认的观点是：易感素质和外部不良因素通过内在生物学因素共同作用而导致疾病的发生。
神经递质功能异常
神经生化研究显示，精神分裂症患者存在有多种神经递质功能异常，主要涉及多巴胺、5-羟色胺、谷氨酸。
中枢多巴胺水平增高，功能亢进，传统抗精神病药均为中枢神经系统多巴胺受体的阻滞剂。中枢5-羟色胺水平异常，新型抗精神病药除了对多巴胺受体有拮抗作用外，还对5-羟色胺受体有拮抗作用。中枢谷氨酸水平低下，功能不足。
神经解剖和神经影像学研究显示，精神分裂症患者颞叶、额叶及边缘系统存在脑组织萎缩，脑室扩大和沟回增宽。
母孕期病毒感染、围产期并发症、幼年的不良应激和躯体疾病与神经系统发育缺陷有关，在精神分裂症发病中有一定影响。
遗传因素
流行病学调查显示，精神分裂症患者亲属中的患病率高于一般人群，血缘关系越近，患病率越高。
分子遗传学研究提示了与精神分裂症有关的易感基因位。目前普遍认为，精神分裂症可能是多基因遗传，发病是由若干基因的叠加作用所致。
不良社会心理因素
不良的生活事件、经济状况、病前性格等社会心理学因素，在精神分裂症发病中可能起到了诱发和促进作用。
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