目前，手汗症的治疗多以手术治疗为主，疗效良好，但是再好的治疗手段也难免会有这样难样的不足，手汗症手术也是如此，也存在着一系列的术后并发症。
1、血、气胸
气胸是本手术术后常见的并发症。引起气胸的原因主要与手术操作有关。术后轻度气胸无需特殊处理，可待气体自行吸收。血胸术后较为少见，主要由于手术操作导致小血管破裂，术后可出现少量血胸。术后少量胸腔积血亦无需特殊处理，待其自行吸收。超过50岁以上者最好不做胸腔镜下胸交感神经链切断术。
2、霍纳综合征
霍纳综合征主要临床表现为患侧眼睑下垂，瞳孔缩小，眼球内陷，同侧额部或胸壁无汗或少汗，其发生与术中星状神经节损伤密切相关，被认为是该术式术后较重的并发症。
3、心脏并发症
本手术最大危险在于解除交感神经对心脏兴奋作用后，引起心动过缓，甚至心跳骤停。因此心脏并发症被认为是本手术最严重的并发症。为防止术后出现严重的心脏并发症，术前常规行心电图检查，一般术前心率低于50次/分，左束支传导阻滞为手术禁忌症。
是该手术术后最常见的并发症，是指在患者手术治疗区域以外的身体其他部位皮肤出汗较手术前明显增多的一种现象，常难以预测。代偿性多汗是目前原发性手汗症治疗术后最棘手的问题，是原发性多汗症患者术后不满意因素之一。
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