丙基硫氧嘧啶是一种治疗甲状腺功能亢进的常用药物，其口服吸收迅速，不良反应发生率较低，适用于临床上大部分甲亢患者的治疗。丙基硫氧嘧啶的治疗疗程通常分为三个阶段，即初治阶段、减药阶段、维持阶段。
初治阶段的甲亢患者一般服用丙基硫氧嘧啶剂量较大，剂量选择需要根据患者的年龄、体重、病情、身体状况等因素由医生具体选择。成年患者每日用量可达300mg~400mg，一般分3~4次服用，重症甲亢患者可适当增加剂量，但不应超过每日600mg。
初治阶段根据病情需要一般在1~3个月。
经过初治阶段治疗后，患者病情一般都得到了很好的控制，症状显著减轻，体重增加，基础代谢率及心率下降，甲状腺功能接近正常，这时就可以考虑将丙基硫氧嘧啶剂量减少。在减药阶段，应根据病情每3~4周递减药量一次，每次减少50~100mg。由于减药过程中病情可能出现波动，应定期随访症状及相关检查，减药过程不宜过快，应保持甲状腺功能正常稳定，逐步过渡至维持阶段，一般需要2~3个月。
在维持阶段，甲亢患者每日服用药物剂量为最小维持量，一般为25~100mg，持续时间一般为1~1.5年，或更长。
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