系统性红斑狼疮的治疗以内用药物治疗为主，常用的药物有非甾体类抗炎药、抗疟药、肾上腺皮质激素和免疫抑制剂等几类，临床应用时根据患者的病情、全身情况等制定个体化的用药方案。
1、非甾体类抗炎药
包括布洛芬、怡美力、莫比可、扶他林、奥斯克等等，可用于缓解系统性红斑狼疮患者的发热、关节肿痛、肌肉酸痛、乏力等症状，应用非甾体类抗炎药可在一定程度上减少肾上腺皮质激素的用量及副作用，但肝肾功能异常的患者应慎用。
2、抗疟药
包括氯喹和羟氯喹，适用于发热、关节炎、皮疹严重的患者，有利于延缓疾病的进展，同时也能减少肾上腺皮质激素的用量。抗疟药在体内的代谢较慢，一般用药后1～2个月可达到疗效高峰，应注意控制用药量，其与眼部的组织亲和性强，易引起角膜沉积和视网膜病变，所以在用药过程中应定期做眼科检查，一般一年至少要检查2次。
3、肾上腺皮质激素
常用的药物有泼尼松、甲泼尼龙等，适用于急性发病、病情重、其他方法不能有效控制的非感染性狼疮高热、血细胞骤减、肾炎、中枢神经系统病变、间质性肺炎及重度肝炎临床应用时需根据患者的病情、全身状况等因素确定药物用量、给药途径及使用疗程，多用短期大剂量静脉冲击疗法合并口服维持疗法，用药过程中要加强监测，避免心律失常、反应性关节病、感染的发生。
4、免疫抑制剂
常用的药物有环磷酰胺、硫唑嘌呤、苯丁酸氮芥、雷公藤多甙和环孢素等，适用于重症、不适宜用大剂量肾上腺皮质激素和难治性系统性红斑狼疮患者。
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