临床细菌性前列腺炎在整个前列腺炎中的比例仅占5﹪~10﹪左右，一项涉及1600余人的研究发现四杯定位细菌培养法在慢性前列腺症状者中的细菌阳性率仅为5.1﹪~10.2﹪，而在健康人中则为0。
且四杯定位细菌培养法的整个过程还是较为繁琐，总的检出率不高，有较多的假阳性和假阴性存在，导致对结果的解释有时模棱两可，影响了病人的依从性和医务人员的实践应用。为此一些学者进行了相关的探索和改良。
1.有学者对疑似细菌性前列腺炎患者采用精液细菌培养。根据世界卫生组织推荐的精液细菌培养要求，精液中经过氧化酶处理后的白细胞数大于等于106/ml时才能进行，结果46.8﹪的慢性细菌性前列腺炎患者的每毫升细菌数大于103，而对照的非细菌性前列腺炎组中仅为6.8﹪，存在显著差异，此后又经12例细菌性前列腺炎患者的精液培养同样取得了可靠诊断。
2.另有学者认为经泌尿生殖药物临床初筛的患者在排除尿道炎、而中段尿又呈正常反应时，可以不再进行膀胱初始尿及中段尿的细菌学培养，仅作肉眼检查及前列腺液与按摩后尿液标本的细菌培养即可。
3.近年来，有学者提出一种更为简便的检查方法，即前列腺按摩前、后尿液检查，包括镜检和培养。其理由是因为在这里检查的目的是明确前列腺内有无细菌感染，因此只要后者的细菌数大于前者即可诊断，反之，若前者增高则同样在应用抗生素后再复测。
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