无精子症是最难治的不育症之一，常给患者带来巨大的身心痛苦，因此疾病的治疗十分重要，而明确诊断是进行治疗的前提。
在诊断无精症时，首先要区分梗阻与否，医师应详细的病史询问，进行相关体格检查以及辅助检查(如精液参数、精浆生化、血性激素检测、B超以及染色体检测等等)，综合以上因素后作出初步诊断。
如患者有明确的生殖道感染史，体检在输精管阴囊段或附睾尾部触及结节，精浆中性α-葡萄糖苷酶降低可初步诊断为梗阻性无精子症;如精液量少、精液不凝固、PH值低于7.0，结合精浆果糖阴性可基本诊断为射精管梗阻;生殖系统和经直肠超声则可明确输精管及精囊有无缺如;而精液脱落细胞检查发现生精细胞则可基本排除梗阻因素。
同时，还可通过过附睾、睾丸穿刺和睾丸活检最终确诊患者是否为梗阻性无精症。
如附睾穿刺找到大量精子，则可确诊为梗阻性无精子症;如穿刺未找到精子，则需要进一步行切取睾丸组织进行活检;如在活检组织中找到的精子数量较少，显微镜每10个高倍视野下只找到1～2条精子，则可初步认为生精功能低下，需结合活检病理进行诊断。
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