畸形精子过多是指异常形态的精子比例过多。畸形精子不具备正常的活动能力和受孕能力，是导致男性不育的主要原因之一。
精子头部异常
精子头部主要结构为浓缩的细胞核和顶体。染色质成熟过程异常可导致位于头部的精子核空泡样缺陷，即精子核异常发生几率较高。
其中还有较为少见的圆头精子综合征，表现为精子头部外观呈圆形，顶体缺无、过小或脱离，无顶体后致密带，而且发生呈现家族性。
精子颈部和中段异常
头尾分离是常见的精子连接段畸形，称为断头精子。有研究显示，大多数断头精子尾部结构正常；小部分这类精子，尾部有残留的连接段并被胞质团包绕，或呈现中段缺失；另有部分精子，尾部有规则的连接段和中段，或者残留的连接段与主段相连。过多残余胞质可导致精子功能下降。
精子鞭毛异常
精子鞭毛异常主要有原发性纤毛运动障碍和纤维鞘发育不良两种表现，前者是一种常染色体隐性遗传疾病，这类患者常表现为支气管扩张、慢性鼻窦炎、内脏逆位和男性不育
纤毛或鞭毛结构不能有力地摆动是其主要致病原因。而后者常见于严重弱精症患者，光学显微镜下可见大部分精子尾部短、僵直、粗或不规则。
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