慢性肾盂肾炎患者除可进行尿常规、尿细胞计数、尿细菌学检查、血常规、肾功能检查等实验室检查外，还可选用X线检查、放射性核素扫描、肾活检等辅助检查。
1.X线检查：慢性肾盂肾炎患者X线检查时，X线平片可显示一侧或双侧肾脏较正常为小，可见两肾大小不等，外形凹凸不平，肾盏、肾盂可变形，有扩张、积水现象，肾实质变薄，有局灶的、粗糙的皮质瘢痕，伴有邻近肾小盏变钝或呈鼓槌状变形。有时显影较差，输尿管扩张此外还可发现有尿流不畅、尿路梗阻如结石、肿瘤或先天性畸形等易感因素。
2.放射性核素扫描：放射性核素扫描可确定患者肾功能损害，显示患肾较小，动态扫描还可查出膀胱输尿管反流。膀胱镜检查可能发现在患侧输尿管口有炎症改变，输尿管插管受阻，静脉注射靛胭脂证实患肾功能减弱。
3.肾活检：光镜检查可见患者肾小管萎缩及瘢痕形成，间质可有淋巴细胞、单核细胞浸润，急性发作时可有中性粒细胞浸润，肾小球可正常或轻度小球周围纤维化，如有长期高血压，则可见肾小球毛细血管壁硬化，肾小球囊内胶原沉着。
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