妊娠期生殖器疱疹在两种情况下使用抗病毒治疗：第一种情况是严重或播散性单纯疱疹病毒感染及初次感染;第二种情况是在孕晚期，为了防止疾病复发，从而预防新生儿感染。
目前的研究资料尚不能肯定，抗病毒治疗能否有效预防新生儿单纯疱疹病毒感染，也不能完全肯定孕期使用抗病毒药物是绝对安全的。但对有症状的生殖器疱疹孕妇，特别是发生在孕晚期的初次感染，抗病毒的好处显著高于其风险。
阿昔洛韦是核酸类似物，对单纯疱疹病毒感染的细胞有高度的特异性，可被细胞内病毒的胸腺嘧啶激活酶选择性激活，抑制病毒复制。阿昔洛韦能通过胎盘，并经胎儿肾脏分泌。研究认为阿昔洛韦对胎儿没有明显的致畸作用，但不排除有致畸的可能。胎儿宫腔内暴露于阿昔洛韦的并发症可能包括肾功能不全、中性粒细胞减少等。
对初次感染单纯疱疹病毒或孕期首次发作并伴有临床症状的孕妇，可口服阿昔洛韦治疗;播散性感染者，可静脉应用阿昔洛韦;复发感染并伴临床症状者，也可应用阿昔洛韦治疗。
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