血清学检查是肝癌常规的检查，其检查指标包括以下几个方面。
同工铁蛋白(AIF)：同工铁蛋白在肝癌时由于肝癌细胞合成增多，释放速度加快故对肝癌诊断有一定意义。
正常人为16μg/L～210μg/L,300μg/L为诊断界值，72.1%的肝癌患者超过此值，假阳性为10.3%，AFP阴性或低浓度AFP肝癌阳性率66.6%，<5cm的小肝癌阳性率62.5%。
甲胎蛋白异质体(FucAFP)：目前以扁豆凝集素(LCA)亲和交叉免疫自显影法测定AFP异质体诊断价值为高。有二种异质体即LCA非结合型(AFP-N-L)和结合型(AFP-R-L)。肝癌含AFP-N-L平均49.13±27.20%(0～100%)，<75%为肝癌诊断标准，阳性率86.0%，随病情恶化而降低。非癌肝病AFP-N-L为93.30±7.66%，假阳性率为1.6%。
醛缩酶同工酶A(ALD-A)：肝癌时ALD-A出现并增高>800ng/ml时有助诊断，AFP阴性肝癌阳性率为73.6%。
血清岩藻糖苷酶(AFu)：AFu属溶酶体酸性水解酶类，主要生理功能是参与岩糖基的糖蛋白、糖脂等生物活性大分子的分解代谢。
AFu超过110Kat/L应考虑原发性肝癌，国内报道AFu诊断原发性肝癌的阳性率为81.2%，对AFP阴性肝癌和小肝癌阳性率分别为76.1%和70.8%，继发性肝癌、良性肝占位病变均阴性，但肝硬化、慢性肝炎的假阳性较高。
综述上述肝癌标志物对原发性肝癌尤其是AFP阴性病例的诊断有辅助意义。
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