几乎所有手术都可能造成一定的并发症，腰椎间盘突出患者手术后发生并发症的几率为10%左右，可有感染、脊柱不稳、脑脊液瘘、脊膜假性囊肿等，出现后应积极治疗，减轻患者痛苦，促进康复。
1、感染：感染是腰椎间盘手术后较为严重的合并症，传统治疗方法是足量使用抗生素并打石膏腰围固定3个月，近年来也主张再次手术冲洗椎间隙，术后抗生素使用两周。
2、脊柱不稳：颈椎病患者术后并发脊柱不稳，导致腰痛加重，有明显脊柱异常活动的患者应行脊柱融合术。
3、脑脊液瘘：脑脊液瘘多在术后3-4天发生，多由经硬膜内手术、硬膜缝合不严或硬膜切口处不缝合而用明胶海绵覆盖硬膜切口处所致。除应用大剂量抗菌素及保持切口敷料干净外，还应将其四周及中央用宽胶布加压固定。
4、脊膜假性囊肿：硬脊膜假性囊肿多在术后几个月内出现，主要表现为腰腿痛，在手术疤痕处或腰骶部有球形囊样物与硬膜粘连，治疗时应及时应用抗生素，防止破溃引起蛛网膜下腔感染，并行硬膜修补术。
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