人为什么会食管癌，这是一个很难回答的问题，当今科学发展的程度，还不能准确解释癌症发生的原因，科学家们正在努力攻克这个难题。
具体到食管癌也是如此，但经过多年的医学实践和几代医务工作者的努力，现已找到一些与食管癌发病有关的因素，如免疫系统不正常、遗传、饮食和环境因素等。
(一)人体的免疫监视系统失常
在与自然环境逐渐适应、协调的漫长进化过程中，人体建立起了一套完善的防御体系一免疫系统，来应对各种不利因素对机体的伤害。人体的免疫体系就像一个国家的国防武装系统，对外防御外敌的侵犯，保卫祖国：对内时刻警惕一些不法分子的破坏，随时准备清除那些危害社会的“毒瘤”。同样，人体的免疫系统是解决人体的内患外侵问题。
免疫系统的功能可归纳为三大类：
1.免疫防御免疫防御功能正常，机体能抵抗各种微生物的入侵，防止感染的发生。免疫防御功能过强，会引起变态反应性疾病，反而会损害机体免疫防御功能过弱则可引起各种免疫缺陷性疾病，比如艾滋病病毒就是侵犯了机体的免疫系统，发病时往往合并多种病菌的感染。
2.免疫稳定免疫稳定功能正常，则不断清除体内衰老或损伤的细胞。当出现稳定失调时，就会出现自身免疫性疾病。
3.免疫监视免疫监视的功能在于杀伤或消灭体内出现的异常或癌变的细胞，及防止感染复发，当免疫监视功能受损时，则可引起肿瘤、癌变或使感染持续存在。
(二)外来因素与食管癌食管癌的病因与许多外界因素有关，尤其与环境、人们的生活习惯密切相关。经过对食管癌高发地区的长期调查发现，发酵霉变食物和饮水中含有致癌物质是食管癌的主要元凶。
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