原因不明性不孕症的常见原因有：
(1)盆腔子宫内膜异位症：子宫内膜异位症是不孕的主要原因之一，并发不孕率高达30%-40%，中、重度的子宫内膜异位症易被发现诊断，但许多轻度子宫内膜异位症，可无临床症状，但恰可成不孕
(2)免疫因素：免疫因素以往并没有作为不孕症常规检查项目，目前正渐渐被重视。抗精子抗体、抗卵透明带抗体、抗子宫内抗体等对精子、卵子结合，受精和胚胎着床均有一定影响，而致免疫性不孕，它占不孕症总数的10%-20%。
(3)宫颈黏液因素：宫颈黏液的物理、化学性质的改变均可直接影响到精子的生存活力及穿透能力。如果排卵期无相应的质稀薄透明、似蛋清样的黏液，则不利于精子穿透宫颈，影响受精。
(4)子宫内膜因素：子宫内膜对雌激素反应差，排卵期子宫内膜薄.不利于受精卵种植。
(5)排卵假象：在不孕妇女中有20%-30%在月经周期中基础体温可出现双相，子宫内膜在月经后期有分泌反应，但实际上卵泡未破裂，卵子未排出，由于卵泡颗粒细胞黄素化，而使体内有一定孕激素水平造成排卵假象。
(6)卵巢黄体功能不全：虽有排卵，但黄体功能不全，孕激素分泌不足，而使子宫内膜分泌不良，不利于受精卵着床。(7)年龄因素：35岁以上的女性，特别是40岁以上者，卵巢功能和卵子的内在质量下降，虽然各项检查均属正常，但自然生育力已下降。
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