甲状腺、胰腺、肾上腺及慢性呼吸道等内科疾病与不孕症有一定关系。前3个腺体与性腺一样，都属于人体的内分泌系统，所分泌的激素之间有密切的关系，都是整个机体完整功能的一个组成部分。如果其中任何一种内分泌腺体功能异常，都会影响其他腺体的正常功能。
(1)甲状腺疾病：甲状腺所分泌的甲状腺激素参与体内各种物质的新陈代谢，对生殖、生理有直接的影响。性腺的发育成熟、维持正常的睾丸生精及卵巢功能都需正常的甲状腺功能的存在。甲状腺功能异常主要表现为甲状腺功能亢进（甲亢）及甲状腺功能减退（甲减）两种疾病。无论甲亢或甲减，疾病严重时，对男女性功能均有影响，可导致男性性欲减退、阳痿、生精功能障碍、精子减少；女性月经紊乱、经量减少，甚至闭经。如果不治疗，两者均可导致不孕
(2)肾上腺疾病：肾上腺与性腺密切相关，它除合成分泌肾上腺皮质激素外，还分泌少量雌激素、雄激素和孕酮等性激素。肾上腺皮质增生又称库欣综合征，其分泌的皮质激素过量，可使垂体促性腺激素及卵巢分泌的雌激素减少，表现为男性性功能低下、阳痿、生精少；女性月经少，或稀发、闭经。
肾上腺皮质功能减退又称阿狄森综合征，此症早期对睾丸、卵巢影响不大，但严重的肾上腺皮质缺乏会引起性功能减退而导致不孕
(3)胰腺功能异常：胰腺所分泌的胰岛素主要调节糖代谢，如分泌不足可造成糖尿病，影响垂体-性腺轴的功能。如不治疗，部分患者可有性成熟迟缓、性欲减退，影响受孕。糖尿病怀孕后易自然流产、死胎，巨大儿的发生率及妊娠并发症发生率明显增加。
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