甲真菌感染引起的指(趾)甲病在皮肤癣菌病中约占30%，而手足癣患者中约50%伴有灰指甲，患病率随年龄的增长而增高。根据真菌侵犯甲的部位和程度不同，可分为白色浅表型、远端侧位甲下型、近端甲下型、全甲毁损型、甲板内型及黑色甲下甲真菌病等。
(1)白色浅表型：90%以上由须癣毛癣菌所致，也可由真菌如黑曲霉、尖孢镰刀菌、枝顶孢等引起。儿童可能由感染白色念珠菌所致。致病菌直接侵犯甲板表层，初起时为小于1mm的白色岛屿状，逐渐扩大成白色云雾状混浊，甲板表面凸凹不平或变形。
(2)近端甲下型：通常由念珠菌属引起，病变起于甲板近端，初为小白点，逐渐扩大可侵及整个甲板。多通过甲小皮而进入甲板或甲床。表现为甲半月和甲根部粗糙肥厚、凹凸不平或破损。
(3)远端侧位甲下型：为最常见的一种，在患甲下碎屑内能找到菌丝，可培养出皮肤癣菌。多由手足癣蔓延而来。真菌从一侧甲廓逐渐累及甲的远端前缘及侧缘并使之增厚、灰黄浑浊，甲板表面凸凹不平或破损。
(4)甲板内型：是真菌感染指(趾)甲的一种新的类型，真菌穿过甲角质层，形成奶白色斑片，无甲下角化过度或甲分离。还有真菌菌丝在甲内形成团块，称为皮肤癣菌瘤，多由苏丹毛癣菌和紫色毛癣菌引起。
(5)全甲毁损型：是各型甲真菌病发展的最终结果。表现为整个甲板被破坏，呈灰黄色、灰褐色，甲板部分或全部脱落，甲板表面残留粗糙角化堆积物，真菌侵入整个甲板，甲结构完全丧失，甲母质和甲床呈乳头瘤样改变，其上覆盖不规则角化团块。甲床亦可增厚、脱屑。
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