生殖器疱疹主要传染源是生殖器疱疹的患者及无症状的单纯疱疹病毒携带者。
1.带病毒与传播
在免疫正常的成人，有2％～3%能从泌尿生殖道中分离HSV-2型，20％～30％能检测到单纯疱疹病毒的脱氧核糖核酸。对于口腔分泌物的检测也能得到相似的数据，这些人就是单纯疱疹病毒的携带者，具有传染性。生殖器疱疹患者也是此病的传染源，他们在第一年病毒携带率高达30%～50%。
2.显性单纯疱疹病毒患者
原发性生殖器HSV-2感染的平均排毒时间约为12天，而从水疱出现至结痂期开始的平均时间为10.5天左右；由于排毒时间与结痂时间之间有明显的重叠，且黏膜损害并不结痂，故患者在损害完全恢复再上皮化之前不应有性生活，因为此期是病毒大量释放期。
3.无症状病毒携带者
生殖器HSV-2感染者比HSV-1感染者更常出现无症状性排毒。病程短于12个月者也常有无症状性排毒。有资料介绍，在诊所就诊的妇女中，78%HSV-2血清学阳性者，无明显单纯疱疹病毒感染史和临床表现，但其中4％为无症状性排毒者，具有传染性。
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