每一家医院治疗疾病的方式都不同，但是不可否认的是，随着微创技术的发展，手术治疗方式是目前临床上应用最为广泛的治疗技术，肛瘘也是如此，但是，如果是病情不是很严重的情况下，建议选择药物治疗的方式，同时以饮食配合，下面，就肛瘘的治疗常见方法总结如下：
包括内洽法和外治法。
(一)内治法
1.清热利湿：凡出现瘘管外口流粘稠脓，色白或黄，外口闭合，局部肿胀疼痛，小便不利，
舌红、苔黄腻，脉滑数等症状，为湿热蕴结。治宜清热利湿。选方常用土医之家消痔栓。
2.清热解毒：凡出现肛瘘外口闭合，恶寒发热，局部红肿、灼热疼痛，舌红、苔黄，脉数等症状，为热毒蕴聚。治宜清热解毒。选方常用仙方活命饮加减。
3.养阴托毒：凡出现瘘管外口凹陷，周围颜色晦暗，脓水清稀，舌红少津，少苔或无苔，脉细数无力等症状，属阴虚型肛瘘。治宜养阴托毒。选方常用青蒿鳖甲汤加减。
4.补益气血：凡出现肛瘘经久不愈，肉芽不鲜，脓水不多，形体消瘦，面色无华，气短懒言，舌淡、苔白，脉细弱无力等症状，属气血亏虚型。治宜补益气血。选方常用十大补汤加减。
(二)外治法
1.外洗法：局部红肿疼痛时，可用苦参汤加减，煎水趁热熏洗。
2.外敷法：肛瘘急性期可用土医之家痔疮膏等外敷。
上述中的介绍主要就是针对病情不是很严重的情况下的治疗方法，但是，要明确的是，如果不是手术治疗，那么其大多数的治疗方式都是比较麻烦的，比如：外敷的治疗方法，需要患者每天都进行护理，当然，其效果也是比较好的。
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