反流性食管炎通常是反流的胆汁和胃酸共同作用于食管粘膜的结果。24小时食管pH监测发现，正常人群均有胃食管反流现象，但无任何临床症状，故称为生理性胃食管反流。在下列情况下，生理性GER可转变为病理性胃食管反流，甚至发展为反流性食管炎。
1.食管胃连接处解剖和生理抗反流屏障的破坏，尤其是食管下端括约肌的异常。
2.食管酸廓清功能的障碍。
3.食管粘膜抗反流屏障功能损害。
4.胃十二指肠功能失常，包括胃排空异常和胃十二指肠反流。
5.裂孔疝：裂孔疝的病人中半数以上发生反流性食管炎。
6.外科手术后：扰乱食管裂孔正常解剖关系及影响食管胃接合部功能的手术均可在手术后发生反流性食管炎，如迷走神经切断术，食管下段肌层切开术，胃大部切除术等，术后长期插胃管，可使贲门不能完全关闭而引起食管炎，但病因解除后可以恢复。
7.妊娠呕吐：因妊娠增加了腹内压力而发生的裂孔疝可以引起反流性食管炎，但分娩后可以恢复，无须任何治疗，呕吐及长期呃逆亦可使贲门口经常开放而发生反流性食管炎，去除病因后可以恢复正常。
8.其他疾病：新生儿及婴幼儿在发育过程中，因有食管下括约肌功能不良而发生反流，随幼儿发育，大部分可减轻，尚有原发性食管下括约肌功能不良使关闭不全，及因器质性疾病如食管下段及贲门部肿瘤，硬皮病和各种造成幽门梗阻的，均能引起反流性食管炎。
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