治疗生殖器疱疹比较有效的是抗病毒药物与免疫抑制剂联合中药。其中药物可以有阿昔洛韦、泛昔洛韦、更昔洛韦，同时也包括输液和口服，也可以用干扰素、胸腺肽、转移因子。而且中药以增强正气为主，长时间用药还没有副作用。
治疗时间比较长，一般半年以上，另外，治疗期间还有很多注意事项：
1.禁酒、禁辛辣食物、禁羊肉狗肉等燥热的食物以及一些补品、禁鱼虾、海鲜、魔芋等发物
2.内裤注意消毒处理
3.避免熬夜和剧烈运动
4.避免感冒等疾病降低抵抗力
5.经常锻炼身体提高抵抗力
6.配偶也要同时检查，如果有问题同时治疗，并避免交叉感染
7.保持积极乐观的心态和治疗的信心
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