有生殖器疱疹复发史的孕妇或者是在妊娠过程中得了生殖器疱疹的，将生殖器疱疹病毒传染给胎儿的危险性很高。另外，妊娠时的HSV培养，并不能预测分娩时的排毒情况。
预防新生儿疱疹的关键是：预防孕妇在妊娠后期获得生殖器HSV的感染。对于易感的孕妇来说，在妊娠期间，应该避免与有HSV感染或疑似感染的性伴有无保护的生殖器及口腔的性接触。
由于妊娠后期，特别是分娩前6周内感染HSV孕妇所生的新生儿，发生新生儿疱疹的可能性很大，建议考虑行剖宫产以及阿昔洛韦预防性治疗。方法是：阿昔洛韦每日20mg/kg，静脉滴注，疗程为10~21天。
在孕妇中，阿昔洛韦等药物的使用尚有争议，如需使用，应权衡利弊并征得患者的知情同意。目前主张，孕妇初发生殖器疱疹的患者可口服阿昔洛韦治疗。对于频发繁复发或新近感染的孕妇生殖器疱疹患者，在妊娠最后4周时，可通过持续的阿昔洛韦治疗以减少活动性损害的出现，从而降低剖宫产率。
对于既往有复发性生殖器疱疹病史，但近足月时无任何复发迹象的孕妇，可不进行阿昔洛韦治疗。对于有活动性皮损或有发作前驱症状的孕妇，在无禁忌症的前提下，可于破膜之前进行剖宫产术，但剖宫产并不能完全防止新生儿疱疹的发生。对于无活动性皮损的孕妇患者，可从阴道分娩，但分娩后要对其新生儿是否出现发热、昏睡、吃奶时吸吮无力、抽搐或发生皮损进行密切监测，以便及时处理。
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