真菌感染尿道但查不出可能与采样误差、检测方法局限或非典型病原体感染有关。尿道真菌感染常见于免疫力低下、长期使用抗生素或糖尿病患者，病原体以白色念珠菌为主，但常规尿培养可能无法检出部分真菌。
尿道真菌感染未检出时，临床常见情况包括采样不规范导致假阴性。尿液样本需清洁中段尿且及时送检，留置时间过长可能影响真菌活性。部分医院采用普通细菌培养而非真菌专用培养基，可能遗漏低浓度真菌。部分非白色念珠菌如光滑念珠菌、热带念珠菌在常规培养基生长缓慢，需延长培养时间或采用显色培养基。部分患者存在混合感染，细菌过度生长可能掩盖真菌检出。
少数情况下需考虑特殊病原体感染。隐球菌、曲霉菌等罕见尿道真菌需特殊染色或分子检测。部分患者可能为定植而非感染，需结合临床症状判断。免疫缺陷患者可能出现非培养依赖性感染，需通过抗原检测或PCR技术确诊。某些地域性真菌如组织胞浆菌在流行区需血清学检测。长期留置导尿管可能形成生物膜，导致常规检测阴性。
建议出现尿频、尿痛、尿液浑浊等症状时复查尿真菌培养，必要时采用膀胱穿刺取尿提高准确性。免疫力低下者可行血清β-D葡聚糖检测辅助诊断。治疗可选用氟康唑胶囊、伊曲康唑胶囊等抗真菌药物，但须在医生指导下使用。日常需保持会阴清洁，避免滥用抗生素，糖尿病患者应严格控制血糖。若症状持续需进行泌尿系统影像学检查排除其他病因。
