定性诊断先判断其是否是小肝癌。进行HBV(乙肝病毒)或HCV(丙肝病毒)的检查吗，若该项目呈阳性，则应该考虑是否有小肝癌。AFP(甲胎蛋白)的检查，出现持续一个月以上的>500ng/ml时，并排除其他的疾病时，则可能是出现了亚临床肝癌。
当AFP(甲胎蛋白)的检查中AFP《20ng/ml时，则应采取以下检查加以辅助超声和肿瘤标记。
定位诊断在判断是小肝癌后，定好其位置，能便于更好的切除和治疗
超声，可检查出1.5-2cm以上的肿瘤
腹腔或肝的动脉造影，可辨别出1-2cm甚至是0.5cm的肿瘤，但对有肝肾功能损害和碘过敏的患者禁忌。
其他还有CT、核磁共振等，这就是诊断小肝癌的手段。多数的小肝癌无明显的临床症状和体征，常在健康体检或乙肝病人定期随访时发现。其手术切除率和术后5年生存率明显高于直径>3cm的肝癌病人。但仍有约百分之10的小肝癌出现异倍体DNA含量，并表现为浸润性生长.突破包膜，形成卫星结节与瘤栓等与大肝癌相同的恶性生物学行为。
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