尽管脑梗死是临床常见疾病之一，但对有些患者，尤其是隐源性卒中患者，明确其病因和发病机制却不容易。近期，Neurology杂志发表了由美国学者Yaghi等报道的一例多发性脑梗死的患者，提示对于这样的患者细致的体格检查和辅助检查对诊断至关重要。
心源性栓塞多发生于心脏病病人，如风湿性心脏病和动脉硬化性心脏病，伴有心房纤维颤动引起者占半数以上，亚急性细菌性心内膜炎瓣膜上的赘生物，心肌梗塞或心肌病的附壁血栓，二尖办脱垂，心脏粘液瘤和心脏外科手术的合并症等的栓子脱落，亦常引起脑栓塞，先天性心脏病房室间隔缺损者，来自体循环静脉系统的栓子，当右心内压大于左心内压时，可不通过肺循环，直接进入颅内动脉而引起脑栓塞，称为反常栓塞。心源性脑栓塞起病急骤，其脑梗死体积较大，神经功能损害通常较重，预后相对较差。
脑梗塞尚有一些少见病因，特别对于青年及婴幼儿卒中更应广泛查找原因，近年来梅毒性血管炎及AIDS引起的感染性血管炎有上升趋势应引起重视，此外系统性红斑狼疮可导致中枢神经系统血管炎，巨细胞动脉炎及多结节性动脉炎亦可见到；红细胞增多症及血小板增多症、高凝状态并不少见；烟雾病可导致多种类型脑梗塞；药物滥用如可卡因、海洛因亦可导致脑血管病变。
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