乙肝汉逊酵母和酿酒酵母只是乙肝疫苗制作过程中的基因表达载体而已，一般不影响疫苗的免疫水平，通常接种效果是一样的，没有哪个更好一说。
乙肝汉逊酵母疫苗是乙型肝炎病毒表面抗原的RNA转运到汉逊酵母进行重组纯化后提纯，加入佐剂吸附后制成；汉逊酵母只是基因表达的载体，一般不影响疫苗的免疫水平。酿酒酵母也是乙肝疫苗制作过程中的一种基因表达载体。
对于乙肝疫苗来说，疫苗效果取决于乙型肝炎病毒表面抗原RNA基因表达的纯度和浓度，佐剂的质量和种类等，通常和用什么酵母作为载体没有多大关系。
用汉逊酵母和酿酒酵母作为载体重组的乙肝疫苗，都可以刺激机体产生抗乙型肝炎病毒的免疫力，常用于预防乙型肝炎；但对于接种重组乙型肝炎疫苗过敏者、对疫苗中的酵母成分过敏者，或存在发热、慢性或急性严重疾病患者，都应禁忌接种。
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