正常育龄妇女在内分泌激素的作用下，阴道上皮细胞增生，其表层细胞含有丰富的糖原非常有利于兼氧乳酸杆菌的生长，这种细菌占阴道的百分之九十以上。
这种乳酸杆菌大量存在就抑制了其他致病菌的生长。在阴道形成了一个正常的生态平衡。
当人体雌激素水平下降导致阴道上皮萎缩，细胞糖原减少，不利于乳酸杆菌生长大量使用抗生素或用碱性液体过度冲洗阴道，抑制乳酸杆菌的生长。性乱性交频繁(因精液pH为7.2-7.8)等导致致病性厌氧菌和加特纳菌大量繁殖，引起阴道微生物生态平衡失调。兼氧性乳酸杆菌减少最终导致细菌性阴道病。
本病实际是正常寄生在阴道内的细菌生态平衡(菌群)失调。生理情况下，阴道内有各种厌氧及需氧菌，其中以产生过氧化氢的乳杆菌占优势。细菌性阴道病时，阴道内乳杆菌减少而其他细菌大量繁殖，主要有加德纳尔菌、动弯杆菌及其他已成厌氧菌，部分患者合并支原体感染。其中以厌氧菌居多，厌氧菌的浓度可以是正常妇女的100~1000倍。厌氧菌繁殖的同时可产生胺类物质，碱化阴道，使阴道分泌物增多并有臭味。
细菌性阴道炎百分之三十患者临床无症状，有症状者的主要表现为阴道分泌物增多，有恶臭味，可伴有轻度外阴瘙痒或烧灼感。分泌物呈灰白色，均匀一致，稀薄，粘度很低，容易将分泌物从阴道壁拭去。
阴道粘膜无充血的炎症表现。细菌学检查无滴虫，真菌或淋病奈氏菌。
细菌性阴道炎是由于正常阴道菌群被大量大厌氧菌、阴道加德纳尔菌和人型支原体所取代而引起的一种临床综合症。曾被命名为嗜血杆菌阴道炎、加纳尔德菌阴道炎、非特异性阴道炎。称其为细菌性阴道病，是因为阴道内有大量不同的细菌，临床及病理特征又无炎症性改变。
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