小儿肺炎支原体感染可能反复发作，反复感染主要与免疫力低下、治疗不彻底、病原体变异、环境暴露、合并基础疾病等因素有关。
儿童免疫系统发育不完善，尤其是婴幼儿或存在先天性免疫缺陷者，对肺炎支原体的清除能力较弱。反复呼吸道感染会进一步削弱免疫功能，形成恶性循环。建议通过均衡营养、规律作息、接种疫苗等方式增强免疫力。
部分家长在患儿症状缓解后自行停药，导致病原体未被完全清除。肺炎支原体对β-内酰胺类抗生素天然耐药，若未规范使用大环内酯类或四环素类药物如阿奇霉素、多西环素，易造成病情迁延。
肺炎支原体可通过基因重组产生抗原变异，逃避机体已建立的免疫应答。某些变异株可能对常用抗生素产生耐药性，导致同一患儿多次感染不同亚型。
幼儿园、学校等集体环境容易发生交叉感染。肺炎支原体通过飞沫传播，在密闭空间内可长期存活。患儿康复后若持续暴露于病原体环境，再感染风险显著增加。
合并哮喘、先天性心脏病、支气管肺发育不良等疾病的患儿，呼吸道防御功能受损，更易发生反复感染。这类患儿感染后常表现为病程长、症状重，需要同时治疗原发病。
预防反复感染需注重日常护理，保持室内空气流通，避免接触呼吸道感染患者。恢复期可进行适度运动如游泳、慢跑，增强心肺功能。饮食应多摄入富含维生素A的胡萝卜、菠菜，以及富含锌的牡蛎、瘦肉等食物。若患儿出现持续咳嗽超过2周、反复发热或活动后气促，需及时复查胸片和血清抗体检测。
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