支原体感染引起的咳嗽通常需要7-14天恢复，具体时间与患者年龄、免疫状态、是否规范治疗、有无并发症以及病原体耐药性等因素有关。
儿童及老年人恢复时间可能延长。儿童免疫系统发育不完善，呼吸道清除能力较弱；老年人常合并慢性病，黏膜修复速度较慢。这两类人群咳嗽症状可能持续2-3周，需密切观察是否出现喘息或呼吸困难。
免疫功能低下者病程易迁延。长期使用免疫抑制剂、艾滋病患者或化疗人群，支原体清除速度明显减慢，咳嗽可能持续1个月以上。这类患者需进行免疫球蛋白检测，必要时需联合免疫调节治疗。
早期足疗程用药可缩短病程。大环内酯类药物如阿奇霉素、克拉霉素是首选，但需完成整个疗程。自行停药可能导致病原体反复增殖，咳嗽症状出现反复，甚至诱发支气管痉挛。
合并肺炎者恢复期延长。当支原体感染累及肺部时，除咳嗽外还会出现持续发热、胸痛等症状，胸片显示肺部浸润影。此类患者需要静脉给药，完全吸收炎症病灶通常需要3-4周。
耐药菌株会延缓康复进程。近年来支原体对大环内酯类耐药率上升，若用药3天无改善，需考虑换用多西环素或莫西沙星。药敏试验可指导精准用药，将咳嗽持续时间缩短30%-50%。
支原体感染期间应保持每日2000毫升温水摄入，稀释呼吸道分泌物；饮食选择百合银耳羹、蜂蜜萝卜汁等润肺食物；避免辛辣刺激及冷饮。恢复期可进行腹式呼吸训练，每日2次每次10分钟，促进膈肌运动改善肺功能。咳嗽持续超过3周或出现咯血、夜间憋醒等症状时，需复查胸片排除肺不张等并发症。
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