病毒性脑炎患儿早期表现为发热、头痛、呕吐，随病情进展可能出现精神萎靡、抽搐甚至昏迷。典型症状主要有前驱感染症状、神经系统兴奋症状、意识障碍、脑膜刺激征及局灶性神经功能缺损。
发病前1-3天常见呼吸道或消化道感染表现，如鼻塞流涕、咽痛咳嗽、腹泻呕吐等低热症状。这些非特异性表现易被误认为普通感冒，需观察是否合并后续神经系统症状。
患儿可能出现异常烦躁、哭闹不安、胡言乱语等精神行为异常。部分病例会伴随幻觉、定向力障碍等大脑皮层受累表现，婴幼儿可表现为持续尖叫或睡眠周期紊乱。
从嗜睡逐渐发展为昏睡或昏迷是病情加重的标志。轻者表现为反应迟钝、注意力不集中，重者出现疼痛刺激无反应、瞳孔对光反射迟钝等脑干功能受损征象。
颈项强直是最具特征性的表现，仰卧位时下颌无法触及胸骨。婴幼儿前囟未闭者可出现囟门膨隆，布氏征和克氏征阳性提示脑膜受累，常伴随畏光、声觉过敏等症状。
病毒侵犯特定脑区可导致偏瘫、面瘫、吞咽困难等运动障碍，或癫痫部分性发作。部分患儿出现共济失调、眼球震颤等小脑症状，严重者可有自主呼吸节律异常。
病毒性脑炎患儿应保持安静环境避免声光刺激，急性期给予流质或半流质饮食防止呛咳。恢复期可进行肢体被动活动预防关节挛缩，定期随访脑电图和神经系统评估。母乳喂养婴儿建议继续哺乳，幼儿可适当补充富含维生素B族的食物如瘦肉、蛋黄等促进神经修复。出现持续高热不退、频繁抽搐或意识障碍加深时需立即就医。
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