肛瘘若不及时治疗可能引发肛周脓肿反复发作、感染扩散甚至诱发癌变。主要风险包括继发感染加剧、肛门功能受损、肛门狭窄、全身炎症反应及恶变概率升高。
存在瘘管时肠道细菌持续侵入肛周软组织，容易形成新的脓肿灶。脓液积聚可能突破直肠壁或皮肤形成多个外口，导致疼痛加剧和发热等全身症状。这种情况需手术彻底清除瘘管和坏死组织，术后可能使用头孢克肟胶囊、甲硝唑片等药物控制感染。
长期炎症会破坏肛门括约肌结构，造成排便控制力下降。部分患者会出现气体或稀便失禁，尤其高位复杂性肛瘘更易损伤深层肌肉。需通过肛门超声评估损伤程度，严重者需进行括约肌修补术。
反复炎症愈合过程会产生纤维瘢痕组织，导致肛管弹性降低。患者可能感到排便困难、便柱变细，需定期扩张治疗。若形成环状狭窄，可能需要肛门成形术恢复通道功能。
慢性感染灶可能引起持续低热、乏力等菌血症症状，炎症指标如C反应蛋白长期偏高。糖尿病患者更易发生败血症等严重并发症，需静脉用左氧氟沙星注射液等强效抗生素干预。
十年以上的慢性肛瘘存在鳞状上皮化生可能，极少数会发展为肛管癌。表现为瘘管分泌物带血、质地变硬或溃疡长期不愈，确诊需活检病理检查。这种情况需广泛切除并配合放化疗。
建议肛瘘患者避免久坐压迫患处，排便后可用温水坐浴清洁。饮食需保持足量膳食纤维摄入，推荐西蓝花、燕麦等食物帮助软化粪便。出现肛周肿痛、渗液等症状时须及时到肛肠外科就诊，通过肛瘘造影或MRI明确瘘管走向后制定手术方案。术后需定期换药并监测伤口愈合情况，避免复发。
