胃神经官能症的症状主要有上腹部疼痛或不适、腹胀、早饱感、恶心呕吐、反酸烧心等。这些症状通常与精神心理因素密切相关，但通过胃镜检查并无明显器质性病变。
这是胃神经官能症最常见的症状之一。患者可能会感到上腹部有隐痛、钝痛、烧灼感或压迫感，疼痛位置多不固定，有时与进食有关，但规律性不强。这种不适感常因情绪波动、精神紧张或压力过大而诱发或加重。治疗上，除了调整情绪和生活方式外，医生可能会建议使用匹维溴铵片来缓解胃肠道平滑肌的痉挛性疼痛，或使用铝碳酸镁咀嚼片来中和胃酸、保护胃黏膜，从而减轻不适。
患者常感觉腹部胀满，尤其是在进食后更为明显，即使吃得不多也会有饱胀感。腹胀可能伴随嗳气，即频繁打嗝，但排气后症状并不能完全缓解。这与胃肠动力功能紊乱有关。针对腹胀，可以遵医嘱使用多潘立酮片来促进胃肠蠕动，帮助胃排空，或使用复方消化酶胶囊来辅助消化食物，减少气体产生。
表现为进食少量食物后即感觉胃部饱胀，无法继续进食，导致进食量明显减少。这种症状与胃的容受性舒张功能受损有关，即胃在进食时不能正常扩张以容纳食物。改善早饱感，除了少食多餐外，医生可能会推荐使用莫沙必利片来增强胃肠动力，改善胃排空功能，或使用健胃消食口服液等中成药来帮助健脾和胃、促进消化。
恶心感常常在饭后或情绪紧张时出现，严重时可发生呕吐，但呕吐物多为胃内容物，呕吐后症状可能暂时缓解。这种恶心呕吐并非由胃炎、溃疡等器质性疾病引起，而是胃肠神经功能紊乱的表现。对于恶心呕吐，可在医生指导下使用甲氧氯普胺片来止吐，或使用维生素B6片来辅助缓解恶心症状，同时注意调节情绪和饮食。
患者会感到胃内容物（包括胃酸）反流至食管或口腔，引起胸骨后或心窝部的烧灼感，即烧心。这与食管下括约肌功能失调、胃排空延迟有关。治疗反酸烧心，医生常会建议使用奥美拉唑肠溶胶囊来抑制胃酸分泌，或使用枸橼酸铋钾胶囊来保护胃黏膜，同时建议避免进食过饱、减少高脂食物摄入，并保持情绪稳定。
胃神经官能症的症状虽然多样且令人不适，但通过调整饮食结构，如少食多餐、避免辛辣刺激性食物，并配合规律作息、适度运动以及心理疏导，多数患者的症状可以得到有效改善。若症状持续不缓解或加重，建议及时就医，在医生指导下进行综合治疗，切勿自行长期用药。
