女性正常月经周期是下丘脑产生促性腺激素释放激素(Gn-RH)，刺激垂体前叶分泌促卵泡生成激素及促黄体生成素。促卵泡生成激素使卵泡开始发育，在少量促黄体生成素作用下，使卵泡分泌雌激素。雌激素作用于子宫内膜而有增殖期变化。
当卵泡成熟时，分泌大量雌激素，使垂体释放大量促黄体生成素，形成促黄体生成素高峰，它能使成熟的卵泡破裂，排卵。破裂的卵泡在促黄体生成素及促卵泡生成激素作用下，形成黄体。
黄体分泌孕激素和雌激素，孕激素可使增殖期的子宫内膜转变为分泌期。
由于黄体分泌大量孕激素和雌激素，反过来抑制下丘脑，使促黄体生成素及促卵泡生成素下降，黄体萎缩，孕激素及雌激素分泌减少，子宫内膜得不到雌孕激素的支持，发生坏死、脱落、月经来潮。
如果卵泡只发育到一定程度，但不成熟，可分泌一定量的雌激素，但达不到雌激素分泌高峰，导致卵巢不能排卵。不排卵则无黄体形成，也就没有孕激素的分泌，这样子宫内膜就一直停留在增殖期而不能转变为分泌期，虽然子宫按时出血，但不是真正的月经，而是无排卵月经，因无排卵，所以必将导致不孕
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功能性子宫出血多数情况下可以自愈，但需根据出血原因、持续时间及严重程度综合判断，常见影响因素有激素水平波动、排卵...
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