胸腺切除术是治疗重症肌无力的主要方法之一，当用药治疗的疗效欠佳伴胸腺肿大和危象发作的病人，可考虑胸腺切除术。但采取凶险切除术者，以病程较短（5年以内）、青年（35岁以下）、女性病人的疗效较佳，完全缓解常在术后2～3年，大约80%的患者手术治疗后，可获得完全缓解或进步。
目前，胸腺切除手术指征几乎扩大到所有适合手术的患者。对久治无效的眼型、全身型获得性自身免疫性重症肌无力成年病人应首选此治疗。现在一般主张凡全身型重症肌无力、无手术禁忌证的重症肌无力病人，甚至多方治疗、久治无效的眼型重症肌无力病人，均可考虑胸腺摘除治疗。
但需要注意的是，胸腺瘤是手术治疗的绝对适应症，对伴有胸腺瘤者，为防恶变，应尽早手术。单纯眼肌型重症肌无力对药物有反应者，可不考虑手术，年龄较大且病程超过5年以上者，手术效果较差。
胸腺切除术只要在良好设备的条件下进行，一般危险性极小，作用机制尚不清楚。
对不宜手术的年老体弱或恶性胸腺瘤患者，也可以进行深度X线，兆伏级X线或钴60作放射源行胸腺放射治疗，有效率约70%左右，病程越短（3年以内），年龄越轻（40岁以下），疗效越好，对儿童应从严掌握。
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