乙肝病毒携带者中约三分之一有反复肝损害，表现为活动性的乙型肝炎或者肝硬化。具体分类如下：
按病程长短分类
乙肝可分为急性乙型肝炎和慢性乙型肝炎，判断是急性还是慢性乙型肝炎在临床诊治中十分重要，二者的治疗原则不同，预后也有很大差异，有时为了区别是急慢性肝炎，往往通过肝穿病理检查来判定。
1）急性乙型肝炎是一种自限性疾病，常常不需要抗病毒治疗，患者血液中HBsAg(+)持续时间低于6个月，6个月内乙型肝炎病毒被机体免疫系统清除，HBsAg阴转，可遗留感染过HBV的血清学标志：HBe、抗HBe及抗HBS三个抗体阳性，但某些患者抗HBS出现时间较晚，低度也可能不高。急性乙型肝炎的关键特点是半年内HBsAg阴转。
2）慢性乙型肝炎如一言以蔽之就是HBV存在于机体内超过6个月。
按病情轻重分类
按病情轻重分类可分为乙肝携带者、活动性乙型肝炎、重型肝炎、肝炎肝硬化。
1）乙肝携带者分慢性HBV-DNA携带者（大三阳，DNA定量高水平但肝功正常处于免疫耐受状态的患者）、非活动性HBsAg携带者（小三阳，HBV-DNA低于检测下限，肝功正常）。
2）活动性乙型肝炎又分为e抗原阳性的慢性乙型肝炎和e抗原阳性的慢性乙型肝炎。
4）重型肝炎又可分为急性重型、亚急性重型和慢性重型肝炎。
按有无出现黄疸（即按症状特点）
可分为黄疸型和无黄疸型，该分型多针对于急性乙型肝炎，即急性黄疸型乙肝和急性无黄疸型乙肝。
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