乙肝患者在治疗中评判疗效的一个重要依据就是乙肝两对半中检查讲演中的阴性与阳性变化，但并不是每一项转阴都代表好转。在两对半检查中，除了表面抗体阳性代表对乙肝病毒产生了免疫之外，其他四项转阴均是乙肝治疗的一个参考目标。
乙肝表面抗原转阴的目标
一般来说，乙肝治疗是不以追求乙肝表面抗原为终极目标的，这是不现实的。乙肝两对半天然全部转阴的可能性长短常小，几乎可以说是罕见的。一般的小三阳(1、4、5阳性)有的人会转成大三阳(1、3、5阳性)，有的是大三阳转成小三阳，可以会变化。但是极少的人可以表面抗原自己清除，尤其在慢性肝炎，发生率非常低。
乙肝两对半检查其他指标转阴
核心抗原是乙肝病毒免疫原性最强的抗原，乙肝病毒感染后，两对半的第五项也就是核心抗体往往都是较高滴度持续阳性的。当然，临床上也有极少数人感染后第5项阴性，机理不明，可能与机体的选择性免疫应答不全和病毒变异有关。
假如是慢性肝炎，转阴可能性比较大的是E抗原转阴，变成E抗体阳性。
但是，这种阴转并不必定就是好转。有的患者E抗原转阴，但HBVDNA是阳性，这可能是在机体的免疫系统作用下，从大三阳状态变成“DNA呈阳性的小三阳”这种状态，它往往代表着前C区变异，临床上这种变化十分常见。
有极少数比较幸运的人表面抗原转阴，机率非常小，多数是在进行抗病毒治疗后。转阴机会较多仍是E抗原转成E抗体，也就是第三项转成第四项。要说明的是1、3、5转成1、4、5，同时HBVDNA仍是阳性，这个情况并不预兆着病情好转，只能说是由野毒株变为变异株。
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