婴儿过敏性痤疮常发生表皮角化亢进及角化不全，棘层肥厚，表皮突增宽下延，真皮乳头层增厚，浅层血管周围有淋巴细胞，组织细胞及少许嗜酸性细胞浸润。
病因较复杂，其发病与多种内外因素有关，常见病因如下：
遗传因素
有些婴儿有遗传过敏素质，家族中也有过敏性痤疮、鱼鳞病、哮喘或过敏性鼻炎等病史，患儿对食物过敏，血中IgE数值增高，嗜酸细胞增高。随着年龄增长，皮肤损害逐渐限局于四肢屈侧处（肘窝、腘窝），往往剧烈抓痒、反复不愈，直至儿童期甚至延续到成人期。
患儿往往由消化道摄入食物性变应原如鱼、虾、牛羊肉、鸡蛋等致敏因素，使体内发生Ⅰ型变态反应。婴儿过敏性痤疮的发病率较高主要是由于患儿皮肤角质层薄，毛细血管网丰富，以及内皮含水及氯化物较多，因而容易发生变态反应
母体雌激素影响
有些婴儿，尤其在新生儿时期，由于母体雌激素通过胎盘传给胎儿，以致新生儿皮脂增多，易致过敏性痤疮。
护理不当
婴儿的皮肤护理不当如过多使用较强的碱性肥皂，过高营养，以及肠内异常发酵等也可引起过敏性痤疮。
机械性摩擦
机械性摩擦如唾液和溢奶经常刺激局部皮肤，也是婴儿过敏性痤疮的诱因。
环境刺激
某些外在因素如日光、紫外线、寒冷、湿热等物理因素，接触丝织品或人造纤维，外用药物以及皮肤细菌感染等，均可引起婴儿过敏性痤疮或加重其病情。
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