系统的体格检查可以为阳痿的诊断提供病因学方面的证据，从而使恰当的有针对性的治疗成为可能。为了发现可能存在的病变，应对内分泌系统疾病、神经系统疾病和心血管系统疾病的常见体征进行有针对性的重点检查。
内分泌系统疾病常见体征
为了发现有无性腺异常导致的阳痿，应对患者的体征、毛发、胡须、骨骼肌肉发育情况、皮下脂肪分布、乳房发育状况、喉结等进行详细体检。为了发现有无甲状腺功能异常，应对甲状腺进行触诊、听诊血管杂音、检查甲状腺眼征、观察有无粘液性水肿等。
心血管系统疾病常见体征心血管系统疾病体征的检查包括测量血压、触诊外周动脉搏动情况、听诊心脏杂音心率等，以此判断有无高血压、严重的心率失常、严重的动脉栓塞或狭窄等。
神经系统疾病常见体征
应比较两侧下腹部、会阴部、阴茎及下肢的感觉差异，这些部位是骶髓感觉神经分布的区域。
另外，球海绵体反射是一个有重要意义的神经系统体征，其原理是当刺激阴茎头时，肛门括约肌会出现收缩反射，这可通过置入肛门内的手指感觉到。若马尾神经损伤时，该反射消失，则刺激龟头时肛门部不再收缩，甚至出现肛门外括约肌松弛。这种情况可因椎间盘中心型突出或缓慢生长的腰髓或骶髓肿瘤引起，这种情况往往会伴有阳痿发生。
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